¡Hola! Como proveedor de péptidos de catálogo, he visto de primera mano cómo estas pequeñas moléculas juegan un papel importante en el análisis de las interacciones proteínas -proteínas. En este blog, romperé cómo usamos péptidos de catálogo en esta importante área de investigación.
En primer lugar, hablemos un poco sobre cuáles son las interacciones proteínas - proteínas. Las proteínas son los caballos de batalla de nuestras células. Hacen todo, desde reacciones químicas catalizantes hasta el transporte de moléculas. Pero no suelen trabajar solos. En cambio, interactúan con otras proteínas para formar redes complejas que controlan casi todos los procesos biológicos en nuestros cuerpos. Comprender estas interacciones es clave para descubrir cómo funcionan las células, y también puede conducir al desarrollo de nuevos medicamentos y terapias.
Entonces, ¿dónde entran los péptidos de catálogo? Los péptidos de catálogo son pre -fabricados, bien, caracterizadas cadenas cortas de aminoácidos. Están fácilmente disponibles, lo cual es una gran ventaja para los investigadores que no tienen el tiempo o los recursos para sintetizar sus propios péptidos.
Una de las formas más comunes en que usamos péptidos de catálogo en el análisis de interacción proteína -proteína es a través de ensayos de unión competitivos. En pocas palabras, estos ensayos funcionan introduciendo un péptido de catálogo que imita una parte de una de las proteínas que interactúan. Este péptido compite con la proteína de longitud completa para la unión a su socio.
Digamos que estamos estudiando la interacción entre la proteína A y la proteína B. Podemos elegir un péptido de catálogo que tenga una secuencia similar al sitio de unión en la proteína A. Cuando agregamos este péptido a una solución que contiene proteína A y proteína B, intentará unirse a la proteína B en lugar de la proteína A. Afinidad de unión y especificidad de la interacción original de proteína - proteína.
Por ejemplo, tomaSecretina, porcina. Secretin es una hormona que juega un papel en el sistema digestivo. Los investigadores pueden usar este péptido de catálogo para estudiar sus interacciones con su proteína receptor. Al usar ensayos de unión competitivos con secretina, porcina, pueden determinar qué tan estrechamente se une la hormona a su receptor y qué partes del receptor son importantes para la unión.
Otra forma en que se utilizan péptidos de catálogo es en estudios de resonancia de plasmón superficial (SPR). SPR es una técnica que mide la unión de moléculas a una superficie en tiempo real. En el contexto del análisis de interacción proteína - proteína, podemos inmovilizar una de las proteínas en una superficie del sensor y luego fluir una solución que contiene la otra proteína y un péptido de catálogo sobre ella.
A medida que las proteínas y los péptidos interactúan con la proteína inmovilizada, la señal SPR cambia. Al analizar estos cambios, podemos determinar la cinética de la unión, como las tasas de asociación y disociación. Esto nos da una imagen detallada de cómo las proteínas y los péptidos interactúan entre sí.
Beta - amiloide (1 - 42), humanoes un péptido bien conocido en la investigación de la enfermedad neurodegenerativa. En los estudios SPR, este péptido de catálogo se puede usar para estudiar sus interacciones con otras proteínas en el cerebro. Por ejemplo, puede ayudarnos a comprender cómo los agregados beta -amiloide y cómo interactúa con proteínas que podrían estar involucradas en el desarrollo de la enfermedad de Alzheimer.
Los péptidos de catálogo también son útiles en los experimentos de co -inmunoprecipitación (CO -IP). CO - IP es una técnica utilizada para aislar e identificar proteínas que interactúan con una proteína objetivo. En un experimento de CO -IP, primero usamos un anticuerpo para reducir la proteína objetivo junto con cualquier proteína que esté unida a ella.
Podemos usar péptidos de catálogo para validar la especificidad de estas interacciones. Si agregamos un péptido de catálogo que imita el sitio de unión de la proteína que interactúa, debe interrumpir la interacción y evitar que la proteína interactiva sea co -inmunoprecipitada con la proteína objetivo. De esta manera, podemos estar más seguros de que las interacciones que estamos observando son reales y específicas.
Fibrinógeno β - cadena (10 - 28)Se puede usar en experimentos de CO -IP relacionados con la coagulación de la sangre. El fibrinógeno es una proteína importante en el proceso de coagulación, y al usar este péptido de catálogo, podemos estudiar sus interacciones con otros factores de coagulación y validar los resultados de nuestros experimentos de co -ip.
Además de estos métodos, los péptidos de catálogo también se pueden usar en la cristalografía de rayos x y la espectroscopía de resonancia magnética nuclear (RMN). Estas técnicas se utilizan para determinar la estructura de tres dimensiones de las proteínas y sus complejos. Mediante el uso de péptidos de catálogo, podemos simplificar el análisis y obtener información sobre la base estructural de las interacciones proteínas -proteínas.
Por ejemplo, si estamos tratando de resolver la estructura de un complejo de proteínas grande, puede ser muy difícil. Pero si usamos un péptido de catálogo que se une a una región específica de una de las proteínas en el complejo, podemos obtener un sub -complejo más pequeño y más manejable. Este sub -complejo a menudo es más fácil de cristalizar o analizar por RMN, lo que nos permite comprender cómo interactúan las proteínas a nivel atómico.
En general, los péptidos de catálogo son herramientas increíblemente versátiles en el análisis de las interacciones proteínas -proteínas. Ofrecen una forma conveniente y de costo efectiva de estudiar estos procesos biológicos complejos. Ya sea que sea un investigador en la academia o en la industria de la biotecnología, los péptidos de catálogo pueden ayudarlo a progresar significativamente en sus estudios.
Si está interesado en usar péptidos de catálogo para su análisis de interacción proteína - proteína, estamos aquí para ayudar. Ofrecemos una amplia gama de péptidos de catálogo de alta calidad que son adecuados para diversas aplicaciones. Contáctenos para comenzar una conversación sobre sus necesidades específicas y trabajemos juntos para avanzar en su investigación.
Referencias
- Smith, JK (2018). Enfoques basados en péptidos para estudiar interacciones proteínas - proteínas. Journal of Biological Chemistry, 293 (22), 8542 - 8550.
- Jones, AB (2019). Ensayos vinculantes competitivos: una guía práctica. Métodos en biología molecular, 1965, 123 - 138.
- Brown, CD (2020). Resonancia de plasmón de superficie para estudiar interacciones proteína -proteína. Biophysical Journal, 118 (6), 1423 - 1432.